Dr. Thaqi, ka përfunduar fakultetin dhe specializimin në Universitetin e Prishtinës, Fakultetin e Mjekësisë.
Dr. Hajdin Thaqi ka përvojë shumëvjeçare si kirurg i ORL-së, dhe gjithashtu ka qenë edhe Drejtor i Klinikës së Otorinolaringologjisë në QKUK. Aktualisht po kontribuon në ekipin mjekësor të Spitalit Kavaja.
Spitali Kavaja është me fat që ka një mjek të përkushtuar dhe profesionalist si Dr. Hajdin Thaqi, i cili jep kontribut të madh në ekipin mjekësor.